Надавно писал о том, как установить Gephi в Windows. Теперь Linux Debian. В Линуксе реализовано открытое ПО по Java. Обычно это выглядит так:
Это значит, что надо отдельно скачивать и устанавливать Java Environment. Иначе Gephi будет глючить. Скачиваем и разахивируем два архива: один Java 8 (https://java.com/en/download/), другой Gephi (https://gephi.org/users/download/). Можно для простоты в корневом каталоге пользователя. Далее очень важный этап - это прописать путь к папке Java в настройках Gephi. Иначе вместо настоящей Java будет запускаться openJDK. Тектовый файл конфигурации находится в одной из 4 папок Gephi - etc. У меня полный путь выглядит так: /home/bkv/gephi-0.9.2/etc Файл ожидаемо называется gephi.conf
